农学学报 ›› 2023, Vol. 13 ›› Issue (12): 20-27.doi: 10.11923/j.issn.2095-4050.cjas2022-0153
兰梅1,2(), 张丽琴1,2, 徐学忠1,2, 胡靖锋1,2, 杨红丽1,2, 杨鼎3, 李崇娟3, 和江明1,2()
收稿日期:
2022-11-09
修回日期:
2023-05-15
出版日期:
2023-12-20
发布日期:
2023-12-19
通讯作者:
作者简介:
兰梅,女,1986年出生,云南昆明人,助理研究员,硕士,研究方向:十字花科蔬菜分子生物学辅助育种。通信地址:650205 云南省昆明市盘龙区北京路2238号园艺所,E-mail:564325868@qq.com。
基金资助:
LAN Mei1,2(), ZHANG Liqin1,2, XU Xuezhong1,2, HU Jingfeng1,2, YANG Hongli1,2, YANG Ding3, LI Chongjuan3, HE Jiangming1,2()
Received:
2022-11-09
Revised:
2023-05-15
Online:
2023-12-20
Published:
2023-12-19
摘要:
为了明确抗根肿病大白菜材料CCR12049中的抗病基因,进一步开发分子标记。以高抗根肿病的高代自交系大白菜CCR12049、高感根肿病的高代自交系大白菜CM12081、CCR12049和CM12081杂交得到的F1及F1自交构建的F2分离群体为试材,通过人工接种鉴定、聚丙烯酰胺凝胶电泳和序列比对。结果显示,该抗病材料中的根肿病抗性由显性单基因控制;36对引物在2个亲本和F1中初步筛选出4对有多态性的引物,在F2中进一步验证,发现只有1对(cr-26)在F2中的扩增结果与表型鉴定一致;2个亲本及F1的PCR产物测序比对发现,在95~111 bp这个位置,抗病亲本和F1的序列完全相同,但是感病材料在这个位置出现了17个碱基(TCTCTATCTCTTACGCA)的缺失。可以推断抗病材料可能是由于这17个碱基的插入从而表现出抗病性,该标记可以将抗感材料区分开,该标记可以作为一个初步筛选白菜抗根肿病的SSR分子标记来利用。
兰梅, 张丽琴, 徐学忠, 胡靖锋, 杨红丽, 杨鼎, 李崇娟, 和江明. 抗根肿病大白菜材料SSR分子标记的初步筛选[J]. 农学学报, 2023, 13(12): 20-27.
LAN Mei, ZHANG Liqin, XU Xuezhong, HU Jingfeng, YANG Hongli, YANG Ding, LI Chongjuan, HE Jiangming. Preliminary Screening of SSR Molecular Markers for Resistance to Clubroot in Brassica rapa L. ssp. pekinensis[J]. Journal of Agriculture, 2023, 13(12): 20-27.
引物名称 | 上游引物(5'-3') | 下游引物(5'-3') |
---|---|---|
cr-1 | TGGCAAAGGATTCATAGCAG | CTCATGGTCCCTTGCTATTC |
cr-2 | ACGCTGATGGATGGGTTGAC | CATCCTCATGGTCCCTTGCT |
cr-3 | GCTGGGTGGGATACGAATGT | AGGCGATGTCGTCTCCGTTA |
cr-4 | GGATGCGATGAGAAGAGGAA | ATAGTAGGCACGCCAGGTCA |
cr-5 | TTCACTTCGCCATTGGTTAC | CCGACCCTAAATTGACTACA |
cr-6 | AGCCTTCTTATGCTCATTCTT | TACGTCCTCAGATCGAAGTTAT |
cr-7 | TGGGATGCTGTATCAGGTGG | GCTCATCTGCCATTTCCATT |
cr-8 | TAACTTCACCCTATTACAAC | TACAGGAAACGAGGACAAAA |
cr-9 | TTAGACCTGCCTCCACAATA | AGACTCTACTTCCGCAACTC |
cr-10 | AGCCAAGGAAGTAAGTAAGA | TCCTCCTCTTGATGCGTTTT |
cr-11 | AGCCTGAGACCAGACTTCGC | TCCTCCTCTTGATGCGTTTT |
cr-12 | TGGTTGAGTGGATGGAGGCG | AAGGTGGAAACATCTCAAGCAG |
cr-13 | ATCGCTCATTCAAATCATCC | TTTGCCGTTCACATTCATAT |
cr-14 | GTCGCCCTTGCGGTTTATTC | AACAGTTCAGGTTGAGTCCC |
cr-15 | AGTCCGTAAGGCGATGTTGT | TATTCTTGCGGGTTACATCC |
cr-16 | TTCAGTCCGTAAGGCGATGT | TATTCTTGCGGGTTACATCC |
cr-17 | GGAAGGGTTGGGTAAGTGAG | ACGCTGCCCTCAAGGAAAGA |
cr-18 | GAGGGCTACTACCTATTTCG | ATTGCCTCTAACGAACCTAC |
cr-19 | AGAACGCAGAAGGTAAGTGA | AAGAATCAACCTCCCTCACA |
cr-20 | AAGAAACAAGAATGTGAGGGAG | TTTGTCTCCAGTCCTCACCC |
cr-21 | AGTGGCTTATGAATGATGAC | ATTGGCAAGGTCACAAGAAC |
cr-22 | CGCACTCACATTCTTCTCAA | ACTTGGACTTTGGCTGGGAC |
cr-23 | TGTGACGCAACGACCAATAA | CCAAAGAAAGAAACCCGTGA |
cr-24 | CGACGCTACACCATCCTTACC | CGTTTACTCCTCCTCTTTGTCG |
cr-25 | TTCTTCCTCTTCTTGTAGGCATCA | TCTAAAGAAACCAACCCATC |
cr-26 | TATGAAGGTGCCACAGATTG | TAAAGCGTGTTTGTTTCATC |
cr-27 | TAACCTTTGACGCTGGAACT | TTGATTGCGATGATTTGGTA |
cr-28 | GTTTCATCCGTTACATTAGC | ATAGGCATTTCTTCCTCCAA |
cr-29 | GAGCGTTCTATTGAGCAGTG | CGTGAAATAAACCGTGAGAA |
cr-30 | CCACTAAGGGCTCTGACGAA | AGAAGCGAACGGCGAAGGAG |
cr-31 | TCGCCGTTTCTTGGATTCTT | ACAGGTGCTAATCCCGAAGG |
cr-32 | TTCGCCATAATGTAAGGTTT | AAATCAATACGAGGGAGCAA |
cr-33 | TCTAATGCCACCATCTCCTG | TCCTCTTTCTGCTTCCTCCA |
cr-34 | GTCTTCGCTTCTCACCTAAACC | TGGCTCCCTGTCACTAATCC |
cr-35 | GACTATTCCATCTCCAGGTT | TTCGCATAATCAATCAAGGT |
cr-36 | GACTATGGGAGCCTCTTGTTC | TTGTTGGACCAGAGGAAGTG |
引物名称 | 上游引物(5'-3') | 下游引物(5'-3') |
---|---|---|
cr-1 | TGGCAAAGGATTCATAGCAG | CTCATGGTCCCTTGCTATTC |
cr-2 | ACGCTGATGGATGGGTTGAC | CATCCTCATGGTCCCTTGCT |
cr-3 | GCTGGGTGGGATACGAATGT | AGGCGATGTCGTCTCCGTTA |
cr-4 | GGATGCGATGAGAAGAGGAA | ATAGTAGGCACGCCAGGTCA |
cr-5 | TTCACTTCGCCATTGGTTAC | CCGACCCTAAATTGACTACA |
cr-6 | AGCCTTCTTATGCTCATTCTT | TACGTCCTCAGATCGAAGTTAT |
cr-7 | TGGGATGCTGTATCAGGTGG | GCTCATCTGCCATTTCCATT |
cr-8 | TAACTTCACCCTATTACAAC | TACAGGAAACGAGGACAAAA |
cr-9 | TTAGACCTGCCTCCACAATA | AGACTCTACTTCCGCAACTC |
cr-10 | AGCCAAGGAAGTAAGTAAGA | TCCTCCTCTTGATGCGTTTT |
cr-11 | AGCCTGAGACCAGACTTCGC | TCCTCCTCTTGATGCGTTTT |
cr-12 | TGGTTGAGTGGATGGAGGCG | AAGGTGGAAACATCTCAAGCAG |
cr-13 | ATCGCTCATTCAAATCATCC | TTTGCCGTTCACATTCATAT |
cr-14 | GTCGCCCTTGCGGTTTATTC | AACAGTTCAGGTTGAGTCCC |
cr-15 | AGTCCGTAAGGCGATGTTGT | TATTCTTGCGGGTTACATCC |
cr-16 | TTCAGTCCGTAAGGCGATGT | TATTCTTGCGGGTTACATCC |
cr-17 | GGAAGGGTTGGGTAAGTGAG | ACGCTGCCCTCAAGGAAAGA |
cr-18 | GAGGGCTACTACCTATTTCG | ATTGCCTCTAACGAACCTAC |
cr-19 | AGAACGCAGAAGGTAAGTGA | AAGAATCAACCTCCCTCACA |
cr-20 | AAGAAACAAGAATGTGAGGGAG | TTTGTCTCCAGTCCTCACCC |
cr-21 | AGTGGCTTATGAATGATGAC | ATTGGCAAGGTCACAAGAAC |
cr-22 | CGCACTCACATTCTTCTCAA | ACTTGGACTTTGGCTGGGAC |
cr-23 | TGTGACGCAACGACCAATAA | CCAAAGAAAGAAACCCGTGA |
cr-24 | CGACGCTACACCATCCTTACC | CGTTTACTCCTCCTCTTTGTCG |
cr-25 | TTCTTCCTCTTCTTGTAGGCATCA | TCTAAAGAAACCAACCCATC |
cr-26 | TATGAAGGTGCCACAGATTG | TAAAGCGTGTTTGTTTCATC |
cr-27 | TAACCTTTGACGCTGGAACT | TTGATTGCGATGATTTGGTA |
cr-28 | GTTTCATCCGTTACATTAGC | ATAGGCATTTCTTCCTCCAA |
cr-29 | GAGCGTTCTATTGAGCAGTG | CGTGAAATAAACCGTGAGAA |
cr-30 | CCACTAAGGGCTCTGACGAA | AGAAGCGAACGGCGAAGGAG |
cr-31 | TCGCCGTTTCTTGGATTCTT | ACAGGTGCTAATCCCGAAGG |
cr-32 | TTCGCCATAATGTAAGGTTT | AAATCAATACGAGGGAGCAA |
cr-33 | TCTAATGCCACCATCTCCTG | TCCTCTTTCTGCTTCCTCCA |
cr-34 | GTCTTCGCTTCTCACCTAAACC | TGGCTCCCTGTCACTAATCC |
cr-35 | GACTATTCCATCTCCAGGTT | TTCGCATAATCAATCAAGGT |
cr-36 | GACTATGGGAGCCTCTTGTTC | TTGTTGGACCAGAGGAAGTG |
[28] |
doi: 10.1016/j.scienta.2011.09.036 URL |
[29] |
杨双娟, 张晓伟, 魏小春, 等. 大白菜抗根肿病基因BraA.Pb.8.4的定位及KASP标记开发[J]. 园艺学报, 2021, 48(7):1317-1328.
doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0656 |
[30] |
原玉香, 赵艳艳, 魏小春, 等. 河南省大白菜根肿病菌生理小种鉴定[J]. 河南农业科学, 2017, 46(7):71-76.
|
[31] |
吉川宏昭. 日本十字花科作物的抗根肿病育种[J].王素,译. 中国蔬菜, 1989(3):55-56.
|
[32] |
孙保亚, 沈向群, 郭海风, 等. 大白菜抗根肿病遗传规律初探[J]. 中国蔬菜, 2005(6):15-17.
|
[33] |
杨双娟, 原玉香, 赵艳艳, 等. 大白菜抗根肿病基因位点CRs的KASP标记开发及应用[J]. 园艺学报, 2021, 48(6):1094-1106.
doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0542 |
[34] |
陈龙正, 徐海, 宋波, 等. 不结球白菜抗根肿病渐渗系的分子辅助选育[J]. 西北植物学报, 2015, 35(8):1530-1533.
|
[35] |
|
[36] |
朱明钊, 张淑江, 张慧, 等. 大白菜抗根肿病的抗源筛选和分子标记鉴定[J]. 中国蔬菜, 2018(3):40-45.
|
[1] |
王超楠, 张斌, 张红, 等. 大白菜抗根肿病基因定位及连锁标记挖掘[J]. 华北农学报, 2019, 34(3):203-208.
doi: 10.7668/hbnxb.201751417 |
[2] |
doi: 10.1007/s00344-009-9090-y URL |
[3] |
doi: 10.1080/07060661003621761 URL |
[4] |
doi: 10.1016/j.hpj.2016.11.004 URL |
[5] |
杨丽梅, 方智远, 张扬勇, 等. 中国结球甘蓝抗病抗逆遗传育种近年研究进展[J]. 园艺学报, 2020, 47(9):1678-1688.
|
[6] |
龙同, 张亚妮, 杨妮娜, 等. 大白菜根肿病生物防治研究进展[J]. 湖北农业科学, 2019, 58(5):5-8.
|
[7] |
张慧, 张淑江, 李菲, 等. 大白菜抗根肿病育种研究进展[J]. 园艺学报, 2020, 47(9):1648-1662.
|
[8] |
doi: 10.1007/s00344-009-9101-z URL |
[9] |
doi: 10.1007/s11032-014-0108-1 URL |
[10] |
董森森. 白菜类作物抗根病种质资源遗传多样性分析及分子标记辅助选择[D]. 郑州: 郑州大学, 2014.
|
[11] |
doi: 10.1134/S1022795418030080 |
[12] |
胡靖锋, 杨红丽, 徐学忠, 等. 微型大白菜“娃娃菜”根肿病抗性遗传规律及分子标记辅助选择研究[J]. 福建农业学报, 2017, 32(2):185-188.
|
[13] |
薛银鸽. 大白菜根肿病抗性基因分子标记与定位[D]. 郑州: 郑州大学, 2014.
|
[14] |
|
[15] |
宋莹, 张清霞, 张淑霞, 等. 大白菜抗根肿病基因定位及分子标记研究进展[J]. 分子植物育种, 2019, 17(21):7130-7137.
|
[16] |
doi: 10.1023/A:1018370418201 URL |
[17] |
doi: 10.1007/s00122-003-1577-5 URL |
[18] |
|
[19] |
doi: 10.3389/fpls.2018.00653 URL |
[20] |
doi: 10.1186/s12870-018-1615-8 |
[21] |
doi: 10.1270/jsbbs.62.170 URL |
[22] |
|
[23] |
|
[24] |
doi: 10.1534/genetics.104.038968 URL |
[25] |
doi: 10.1371/journal.pone.0085307 URL |
[26] |
doi: 10.1186/1471-2164-15-1166 |
[27] |
doi: 10.1038/s41598-017-04903-2 |
[1] | 曾莉, 刘颖圣, 徐小万. 赏食兼用型辣椒花瓣和果实紫色性状遗传分析[J]. 农学学报, 2023, 13(11): 55-59. |
[2] | 盘文政, 王斌, 张琪, 毛明林, 李诚, 字文霖. 安宁油菜根肿病生防技术应用研究[J]. 农学学报, 2022, 12(7): 17-20. |
[3] | 李显富, 杨惠, 安雪琴, 王陈梓骏, 戴秀梅, 张建奎. 烤烟新品系‘狮柳烟’的特征特性及SSR分子标记鉴定[J]. 农学学报, 2022, 12(1): 28-34. |
[4] | 丛桂芝, 王瑾, 陈淑英, 石游, 陶俊, 阿布地萨拉木·艾尼外尔, 许正. 树上干杏指纹图谱构建与亲缘关系研究初探[J]. 农学学报, 2021, 11(1): 51-56. |
[5] | 赵依杰, 林丽霞, 姚立萍, 骆志坚, 胡章琼. 福州地区柑橘种质资源的ISSR分析[J]. 农学学报, 2020, 10(1): 72-76. |
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