树上干杏指纹图谱构建与亲缘关系研究初探

doi:10.11923/j.issn.2095-4050.cjas20191100269

摘要/Abstract

摘要：

为进一步探究树上干杏亲缘关系,本研究利用SSR分子标记引物技术,通过PCR扩增及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,对树上干杏等9个杏品种（类型）的18对SSR多态性引物进行鉴定,获得DNA指纹图谱,从DNA水平鉴定伊犁树上干杏品种与其他杏品种（类型）之间的亲缘关系远近。对各杏品种（类型）间亲缘关系进行聚类分析,结果表明:杏1（树上干杏1号）和杏2（树上干杏2号）2个品种差异较大,杏4（树上干杏4号）与杏1（树上干杏1号）为同一类。与杏1（树上干杏1号）亲缘关系由近及远依次为巩留野杏、珍珠油杏、第四师61团古杏,其遗传相似性系数范围为0.673~0.808。杏3（树上干杏3号）与杏2（树上干杏2号）为同一类,与李光杏亲缘关系较近,其遗传相似性系数范围为0.654~0.846。霍城野杏与树上干杏亲缘关系较远。

关键词: 树上干杏, SSR分子标记, DNA指纹图谱, 聚类分析, 亲缘关系

Abstract:

To explore the genetic relationship of Shushanggan apricot, SSR molecular marker technology was used by PCR amplification and a modified polyacrylamide gel electrophoresis, 18 pairs of SSR polymorphism primers were identified in nine varieties (types) of Shushanggan apricot and other apricots, to get the DNA fingerprint. The genetic relationship between Shushanggan apricot and other apricot varieties (types) were identified from different DNA levels. The genetic relationship of apricot varieties (types) were analyzed by clustering. The results showed that Shushanggan apricot had two different varieties, namely Shushanggan apricot No.1 and Shushanggan apricot No.2. Shushanggan apricot No.4 and Shushanggan apricot No.1 were the same type. The close genetic relationship to Shushanggan apricot No.1 was Gongliu wild apricot> pearl oil apricot> Disishi 61 Tuan ancient apricot, the genetic similarity coefficient ranged from 0.673 to 0.808. Shushanggan apricot No.3 and Shushanggan apricot No.2 were the same type, and they were closely related to Liguang apricot, the genetic similarity coefficient ranged from 0.654 to 0.846. Huocheng wild apricot was far related to Shushanggan apricot.

Key words: Shushanggan Apricot, SSR Molecular Marker, DNA Fingerprint, Cluster Analysis, Genetic Relationship

中图分类号:

S662.2

丛桂芝, 王瑾, 陈淑英, 石游, 陶俊, 阿布地萨拉木·艾尼外尔, 许正. 树上干杏指纹图谱构建与亲缘关系研究初探[J]. 农学学报, 2021, 11(1): 51-56.

Cong Guizhi, Wang Jin, Chen Shuying, Shi You, Tao Jun, Abudusalamu Ainiwaier, Xu Zheng. The Fingerprint Structure and Genetic Relationship of Shushanggan Apricot: A Preliminary Study[J]. Journal of Agriculture, 2021, 11(1): 51-56.

图/表 6

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样品编号	品种（类型）	取样地	来源与特征
杏1	树上干杏1号	第四师61团阿布都苏·阿布都拉家老树 (80°33'53.77"N、44°15'22.6"E), 海拔816.4 m	据调查为19世纪60年代从乌兹别克斯坦引进繁育保留,1991年开始扩大繁育推广栽培。已审定良种,单果平均重15 g左右,长圆形,黄色,阳面红色,有肉眼难以分辨的极少茸毛,可溶性固形物含量23%,成熟期6月下旬,鲜食、制干、仁用均可,抗病虫性较弱
杏2	树上干杏2号	第四师61团阿布都苏·阿布都拉家 (80°33'52.9"N、44°15'22.38"E), 海拔818.2 m	已审定良种,单果平均重16 g左右,圆形,黄色,阳面红色,有肉眼难以分辨的极少茸毛,可溶性固形物含量23%,成熟期7月上中旬,鲜食、制干、仁用均可
杏3	树上干杏3号	第四师61团库尔班江·吐尔逊家 (44°15'25"N、80°33'53"E), 海拔811.2 m	据调查为19世纪60年代从乌兹别克斯坦引进繁育保留,小果树上干杏,已认定良种结实率高,单果重10~12 g,圆形,有肉眼难以分辨的极少茸毛,壳薄,轻嗑即破,双仁率33%,可溶性固形物20%,果实成熟期7月上旬,鲜食、仁用
杏4	树上干杏4号	第四师61团库尔班江·吐尔逊家 (44°15'25"N、80°33'54"E), 海拔820.4 m	小果树上干杏,结实率高,单果重10~12 g,长圆形,有肉眼难以分辨的极少茸毛,壳薄,轻嗑即破,双仁多,仁极香,微苦,可溶性固形物含量 20.4%,果实成熟期7月初,鲜食、仁用
杏5	李光杏	第四师61团阿布都苏·阿布都拉家 (44°15'23"N、80°33'54"E), 海拔815.4 m	零星栽植。单果平均重18.5 g,圆形,橙黄色,果面光滑无毛, 可溶性固形物含量20.65%,粘核,成熟期6月下旬,鲜食,甜仁
杏6	古杏	第四师61团古杏（阿依古丽） (44°15'40"N、80°33'33"E), 海拔834.5 m	1883年栽植,主干径93 cm,树高8 m,果大,单果平均重18 g,圆形, 有极少茸毛,成熟期7月上旬,鲜食,甜仁
杏7	巩留野杏	巩留县提克阿热克乡铁尔木图萨依山沟 (43°24'2"N、82°1'14"E), 海拔1288 m	巩留县提克阿热克乡铁尔木图萨依山沟野苹果等阔叶混交林, 果实甜,甜仁,7月初至中旬成熟
杏8	霍城野杏（甜仁杏）	霍城大西沟乡庙儿沟南坡 (44°26'13"N、80°46'47"E), 海拔1226 m	霍城大西沟乡庙儿沟南坡野苹果、野杏、山楂等阔叶混交林内, 树龄50年,果实近圆形,黄色,阳面有暗红霞,单果平均重9.2 g左右, 可溶性固形物含量14.8%,仁甜,多双仁
杏9	珍珠油杏	伊宁县吉里于孜镇北山坡张福其杏园 (44°0'4"N、81°32'31"E), 海拔887 m	1985年山东省新泰安市旋崮山发现,2006年通过审定。单果平均重27 g左右,椭圆形,橙黄色,果面光滑似被一层油脂,成熟期6月20日左右,比树上干杏成熟早约1周,鲜食、制干、仁用均可。伊犁河谷2012年引进栽培

样品编号	品种（类型）	取样地	来源与特征
杏1	树上干杏1号	第四师61团阿布都苏·阿布都拉家老树 (80°33'53.77"N、44°15'22.6"E), 海拔816.4 m	据调查为19世纪60年代从乌兹别克斯坦引进繁育保留,1991年开始扩大繁育推广栽培。已审定良种,单果平均重15 g左右,长圆形,黄色,阳面红色,有肉眼难以分辨的极少茸毛,可溶性固形物含量23%,成熟期6月下旬,鲜食、制干、仁用均可,抗病虫性较弱
杏2	树上干杏2号	第四师61团阿布都苏·阿布都拉家 (80°33'52.9"N、44°15'22.38"E), 海拔818.2 m	已审定良种,单果平均重16 g左右,圆形,黄色,阳面红色,有肉眼难以分辨的极少茸毛,可溶性固形物含量23%,成熟期7月上中旬,鲜食、制干、仁用均可
杏3	树上干杏3号	第四师61团库尔班江·吐尔逊家 (44°15'25"N、80°33'53"E), 海拔811.2 m	据调查为19世纪60年代从乌兹别克斯坦引进繁育保留,小果树上干杏,已认定良种结实率高,单果重10~12 g,圆形,有肉眼难以分辨的极少茸毛,壳薄,轻嗑即破,双仁率33%,可溶性固形物20%,果实成熟期7月上旬,鲜食、仁用
杏4	树上干杏4号	第四师61团库尔班江·吐尔逊家 (44°15'25"N、80°33'54"E), 海拔820.4 m	小果树上干杏,结实率高,单果重10~12 g,长圆形,有肉眼难以分辨的极少茸毛,壳薄,轻嗑即破,双仁多,仁极香,微苦,可溶性固形物含量 20.4%,果实成熟期7月初,鲜食、仁用
杏5	李光杏	第四师61团阿布都苏·阿布都拉家 (44°15'23"N、80°33'54"E), 海拔815.4 m	零星栽植。单果平均重18.5 g,圆形,橙黄色,果面光滑无毛, 可溶性固形物含量20.65%,粘核,成熟期6月下旬,鲜食,甜仁
杏6	古杏	第四师61团古杏（阿依古丽） (44°15'40"N、80°33'33"E), 海拔834.5 m	1883年栽植,主干径93 cm,树高8 m,果大,单果平均重18 g,圆形, 有极少茸毛,成熟期7月上旬,鲜食,甜仁
杏7	巩留野杏	巩留县提克阿热克乡铁尔木图萨依山沟 (43°24'2"N、82°1'14"E), 海拔1288 m	巩留县提克阿热克乡铁尔木图萨依山沟野苹果等阔叶混交林, 果实甜,甜仁,7月初至中旬成熟
杏8	霍城野杏（甜仁杏）	霍城大西沟乡庙儿沟南坡 (44°26'13"N、80°46'47"E), 海拔1226 m	霍城大西沟乡庙儿沟南坡野苹果、野杏、山楂等阔叶混交林内, 树龄50年,果实近圆形,黄色,阳面有暗红霞,单果平均重9.2 g左右, 可溶性固形物含量14.8%,仁甜,多双仁
杏9	珍珠油杏	伊宁县吉里于孜镇北山坡张福其杏园 (44°0'4"N、81°32'31"E), 海拔887 m	1985年山东省新泰安市旋崮山发现,2006年通过审定。单果平均重27 g左右,椭圆形,橙黄色,果面光滑似被一层油脂,成熟期6月20日左右,比树上干杏成熟早约1周,鲜食、制干、仁用均可。伊犁河谷2012年引进栽培

试剂	用量/μL
50 ng/μL模板DNA	1.0
10倍的缓冲液（含Mg²⁺）	2.5
三磷酸碱基脱氧核苷酸(2.5 mmol/L)	1.6
10 pmol/L正向引物	0.5
10 pmol/L反向引物	0.5
5 U/μL Taq复合酶	0.2 5
超纯水	18.65

试剂	用量/μL
50 ng/μL模板DNA	1.0
10倍的缓冲液（含Mg²⁺）	2.5
三磷酸碱基脱氧核苷酸(2.5 mmol/L)	1.6
10 pmol/L正向引物	0.5
10 pmol/L反向引物	0.5
5 U/μL Taq复合酶	0.2 5
超纯水	18.65

试剂	每板用量
聚丙烯酰胺胶母液	6 mL
10×TBE	2 mL
超纯水	10 mL
10%过硫酸胺	200 μL
TEMED	20 μL