Journal of Agriculture ›› 2023, Vol. 13 ›› Issue (3): 44-51.doi: 10.11923/j.issn.2095-4050.cjas2021-0220
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YANG Yingxia1(), CHEN Rui1, YAO Xingwei2()
Received:
2021-12-30
Revised:
2022-03-05
Online:
2023-03-20
Published:
2023-04-04
YANG Yingxia, CHEN Rui, YAO Xingwei. Molecular Breeding of Brassica oleracea Vegetables: A Review[J]. Journal of Agriculture, 2023, 13(3): 44-51.
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URL: http://nxxb.caass.org.cn/EN/10.11923/j.issn.2095-4050.cjas2021-0220
品种 | 测序策略 | 组装基因组 (Mb) | 锚定基因组(Mb) | Scaffold 50 (Mb) | 基因数 | 参考文献 |
---|---|---|---|---|---|---|
02-2 | Illumina + Roche 454 + Sanger + genetic map | 539.91 | 389 | 1.457 | 45,758 | [ |
TO1000 | Illumina + Roche 454 + Sanger + genetic map | 488.6 | 460 | 0.85 | 59,225 | [ |
HDEM | Illumina + Nanopore + Bionano physical map + genetic map | 554.97 | 528.9 | 29.516 | 61,270 | [ |
C-8 | Illumina + Nanopore | 584.6 | - | 2.11 | 47,772 | [ |
D134 | Illumina + Nanopore +Hi-C | 529.9 | - | 61.74 | 44,701 | [ |
JZS | Illumina + PacBio + Hi-C | 561.16 | - | 2.37 | 59,064 | [ |
Korso_1401 | PacBio + Illumina + Bionano + Hi-C | 566.9 | 549.7 | 4.97 | 60,640 | [ |
OX-heart_923 | PacBio + Illumina + Bionano + Hi-C | 587.7 | 565.4 | 3.10 | 62,232 | [ |
品种 | 测序策略 | 组装基因组 (Mb) | 锚定基因组(Mb) | Scaffold 50 (Mb) | 基因数 | 参考文献 |
---|---|---|---|---|---|---|
02-2 | Illumina + Roche 454 + Sanger + genetic map | 539.91 | 389 | 1.457 | 45,758 | [ |
TO1000 | Illumina + Roche 454 + Sanger + genetic map | 488.6 | 460 | 0.85 | 59,225 | [ |
HDEM | Illumina + Nanopore + Bionano physical map + genetic map | 554.97 | 528.9 | 29.516 | 61,270 | [ |
C-8 | Illumina + Nanopore | 584.6 | - | 2.11 | 47,772 | [ |
D134 | Illumina + Nanopore +Hi-C | 529.9 | - | 61.74 | 44,701 | [ |
JZS | Illumina + PacBio + Hi-C | 561.16 | - | 2.37 | 59,064 | [ |
Korso_1401 | PacBio + Illumina + Bionano + Hi-C | 566.9 | 549.7 | 4.97 | 60,640 | [ |
OX-heart_923 | PacBio + Illumina + Bionano + Hi-C | 587.7 | 565.4 | 3.10 | 62,232 | [ |
性状 | 甘蓝种 | 性状相关基因 | 参考文献 |
---|---|---|---|
雄性不育 | B.oleracea var.capitata | BoCYP704B1 | [ |
B.oleracea var.botrytis | BoGH3.13-1 | [ | |
开花及花球形成 | B.oleracea var.botrytis | CDAG1 | [ |
B.oleracea var.italica | BoFLC2、BoFLC3 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BolGRF6 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoFLC1.C9 | [ | |
B.oleracea var.botrytis | BobCAL | [ | |
B.oleracea var.botrytis | AP1、CAL | [ | |
B.oleracea | miR172D、 BoFLC.C2 | [ | |
抗虫/抗病性 | B.oleracea | FocBo1 | [ |
B.oleracea var.capitata | Cry1Aa | [ | |
B.oleracea var.botrytis | Ppa207 | [ | |
B.oleracea var.capitata | Bol031422 | [ | |
B.oleracea var.capitata | AvrLm14 | [ | |
花青素合成 | B.oleracea var.capitata | BoMYC1.2 (bHLH)、BoTTG1 (WDR) | [ |
B.oleracea var.acephala | BoPr | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoNAC019 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoMYBL2-1 | [ | |
B.oleracea var.italica | qPH.C01-2 | [ | |
B.oleracea var.italica | BoTT8 | [ | |
B.oleracea var.botrytis | Gr | [ | |
B.oleracea | BoMYB2 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BoDFR1 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoMYB113.1、BoMYBL2.1 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoLBD | [ | |
硫代葡萄糖苷合成 | B.oleracea var. alboglabra Bailey | MYB28 | [ |
B.oleracea var.italica | BoMYB51 | [ | |
B.oleracea var. alboglabra Bailey | BoaMYB51s | [ | |
B.oleracea var.italica | BoMYB29 | [ | |
B.oleracea var.italica | BoTSB1、BoTSB2 | [ | |
自交不亲和 | B.oleracea var.capitata | MLPKn1 | [ |
杂交致死 | B.oleracea var.capitata | BoHL1、BoHL2 | [ |
蜡质合成 | B.oleracea var.capitata | Cgl1 | [ |
B.oleracea var.capitata | BoWax1 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoGL-3 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoCER2 | [ | |
非生物胁迫 | B.oleracea var.acephala | BoRACK1 | [ |
B.oleracea var.capitata | BoALMT1 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BocMBF1c | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoCSDP5v | [ | |
叶型 | B.oleracea var.acephala | BoFL | [ |
B.oleracea var.acephala | BoLMI1a | [ | |
叶绿素含量 | B.oleracea var.italica | Bol-miR171b | [ |
有毛/无毛 | B.oleracea var.acephala | BoTRY | [ |
性状 | 甘蓝种 | 性状相关基因 | 参考文献 |
---|---|---|---|
雄性不育 | B.oleracea var.capitata | BoCYP704B1 | [ |
B.oleracea var.botrytis | BoGH3.13-1 | [ | |
开花及花球形成 | B.oleracea var.botrytis | CDAG1 | [ |
B.oleracea var.italica | BoFLC2、BoFLC3 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BolGRF6 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoFLC1.C9 | [ | |
B.oleracea var.botrytis | BobCAL | [ | |
B.oleracea var.botrytis | AP1、CAL | [ | |
B.oleracea | miR172D、 BoFLC.C2 | [ | |
抗虫/抗病性 | B.oleracea | FocBo1 | [ |
B.oleracea var.capitata | Cry1Aa | [ | |
B.oleracea var.botrytis | Ppa207 | [ | |
B.oleracea var.capitata | Bol031422 | [ | |
B.oleracea var.capitata | AvrLm14 | [ | |
花青素合成 | B.oleracea var.capitata | BoMYC1.2 (bHLH)、BoTTG1 (WDR) | [ |
B.oleracea var.acephala | BoPr | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoNAC019 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoMYBL2-1 | [ | |
B.oleracea var.italica | qPH.C01-2 | [ | |
B.oleracea var.italica | BoTT8 | [ | |
B.oleracea var.botrytis | Gr | [ | |
B.oleracea | BoMYB2 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BoDFR1 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoMYB113.1、BoMYBL2.1 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoLBD | [ | |
硫代葡萄糖苷合成 | B.oleracea var. alboglabra Bailey | MYB28 | [ |
B.oleracea var.italica | BoMYB51 | [ | |
B.oleracea var. alboglabra Bailey | BoaMYB51s | [ | |
B.oleracea var.italica | BoMYB29 | [ | |
B.oleracea var.italica | BoTSB1、BoTSB2 | [ | |
自交不亲和 | B.oleracea var.capitata | MLPKn1 | [ |
杂交致死 | B.oleracea var.capitata | BoHL1、BoHL2 | [ |
蜡质合成 | B.oleracea var.capitata | Cgl1 | [ |
B.oleracea var.capitata | BoWax1 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoGL-3 | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoCER2 | [ | |
非生物胁迫 | B.oleracea var.acephala | BoRACK1 | [ |
B.oleracea var.capitata | BoALMT1 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BocMBF1c | [ | |
B.oleracea var.capitata | BoCSDP5v | [ | |
叶型 | B.oleracea var.acephala | BoFL | [ |
B.oleracea var.acephala | BoLMI1a | [ | |
叶绿素含量 | B.oleracea var.italica | Bol-miR171b | [ |
有毛/无毛 | B.oleracea var.acephala | BoTRY | [ |
甘蓝种 | 敲除基因 | 表型 | 基因功能 | 参考文献 |
---|---|---|---|---|
B.oleracea var.capitata | FRI | 早花 | 通过激活开花抑制基因FLC的表达来抑制开花 | [ |
PDS | 白化苗 | 调控叶片白化的关键基因 | ||
BoSRK3 | - | 抑制自交不亲和性 | [ | |
BoPDS | 白化苗 | 在植物中具有光保护作用且可以影响类胡萝卜素合成 | ||
BoMS1 | 雄性不育 | 雄性不育 | ||
GIGANTEA (GI) | 早花 | 调节开花时间 | [ | |
BoPDS | 白化苗 | 调控叶片白化的关键基因 | [ | |
MYB28 | 低含量芥子油苷 | 参与脂肪族芥子油苷(A-GSL)的生物合成 | [ | |
BoCER1 | 表皮无蜡 | 叶表皮蜡质合成相关 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BolC.GA4.a | 植株矮化 | 参与赤霉素生物合成 | [ |
B.oleracea | BoFAD2 | - | 催化油酸脱氢形成 | [ |
B.oleracea var. alboglabra | BaPDS | 白化苗 | 调控叶片白化的关键基因 | [ |
甘蓝种 | 敲除基因 | 表型 | 基因功能 | 参考文献 |
---|---|---|---|---|
B.oleracea var.capitata | FRI | 早花 | 通过激活开花抑制基因FLC的表达来抑制开花 | [ |
PDS | 白化苗 | 调控叶片白化的关键基因 | ||
BoSRK3 | - | 抑制自交不亲和性 | [ | |
BoPDS | 白化苗 | 在植物中具有光保护作用且可以影响类胡萝卜素合成 | ||
BoMS1 | 雄性不育 | 雄性不育 | ||
GIGANTEA (GI) | 早花 | 调节开花时间 | [ | |
BoPDS | 白化苗 | 调控叶片白化的关键基因 | [ | |
MYB28 | 低含量芥子油苷 | 参与脂肪族芥子油苷(A-GSL)的生物合成 | [ | |
BoCER1 | 表皮无蜡 | 叶表皮蜡质合成相关 | [ | |
B.oleracea var.acephala | BolC.GA4.a | 植株矮化 | 参与赤霉素生物合成 | [ |
B.oleracea | BoFAD2 | - | 催化油酸脱氢形成 | [ |
B.oleracea var. alboglabra | BaPDS | 白化苗 | 调控叶片白化的关键基因 | [ |
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doi: 10.1038/ncomms4930 |
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doi: 10.1038/s41477-018-0289-4 pmid: 30390080 |
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doi: 10.1038/s41438-019-0164-0 |
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doi: 10.1038/s41598-020-69389-x pmid: 32709963 |
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doi: 10.1007/s00122-020-03664-3 |
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doi: 10.1186/s12915-021-01031-2 |
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doi: 10.1007/s00122-017-2936-y URL |
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doi: 10.1038/s41438-020-0257-9 |
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doi: 10.1007/s00122-017-2899-z URL |
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doi: 10.1186/s12864-020-07345-9 |
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doi: 10.1016/j.plantsci.2016.10.009 URL |
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doi: 10.1038/s41598-018-31987-1 |
[23] |
doi: 10.1007/s00122-017-3047-5 URL |
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doi: 10.1186/s12863-019-0740-1 |
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doi: 10.1038/s41438-020-00378-x |
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doi: 10.1186/s12870-018-1290-9 |
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doi: 10.1007/s00122-020-03688-9 |
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doi: 10.1007/s00425-021-03746-6 |
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doi: 10.3389/fpls.2018.01599 URL |
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Abstract |
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