基于R语言的亚麻种质资源农艺性状相关及聚类分析

doi:10.11923/j.issn.2095-4050.cjas20190700124

农学学报 ›› 2020, Vol. 10 ›› Issue (1): 7-12.doi: 10.11923/j.issn.2095-4050.cjas20190700124

所属专题：资源与环境

基于R语言的亚麻种质资源农艺性状相关及聚类分析

张丽丽¹, 耿立格², 孙娟², 王玉祥¹, 曲志华¹, 李世芳¹, 乔海明¹()

¹ 张家口市农业科学院,张家口 075000
² 河北省农林科学院粮油作物研究所,石家庄 050035

收稿日期:2019-07-16 修回日期:2019-08-30 出版日期:2020-01-22 发布日期:2020-01-22
通讯作者: 乔海明 E-mail:qhm1965@163.com
作者简介:张丽丽,女,1983年出生,河北保定人,副研究员,硕士研究生,主要从事胡麻新品种选育及栽培技术研究。通信地址：075000 张家口市经开区惠通街张家口市农业科学院,Tel：0313-7155779,E-mail：zhanglili57@126.com
基金资助:
现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目“胡麻抗逆育种岗位”(CARS-14-1-08);国家科技资源共享服务平台“国家农作物种质资源共享服务平台”(NICGR2018-23);河北省现代农业产业技术体系油料产业创新团队“特色油料岗位”(HBCT2018090204)

Agronomic Traits of Flax Germplasm Resources: Relationship and Cluster Analysis Based on the R Language

Zhang Lili¹, Geng Lige², Sun Juan², Wang Yuxiang¹, Qu Zhihua¹, Li Shifang¹, Qiao Haiming¹()

¹ Zhangjiakou Academy of Agricultural Sciences of Hebei, Zhangjiakou 075000, Hebei, China
² Institute of Cereal and Oil Crops, Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei, China

Received:2019-07-16 Revised:2019-08-30 Online:2020-01-22 Published:2020-01-22
Contact: Haiming Qiao E-mail:qhm1965@163.com

摘要/Abstract

摘要：

本研究旨在通过对河北省种质资源库部分亚麻资源进行进一步的表型鉴定,以期探索亚麻种质资源的农艺性状相关性和聚类研究,用于亚麻新品种选育研究工作。本试验以499份亚麻种质资源为材料,应用R语言对亚麻主要农艺性状进行相关性分析,得出各性状间的相关系数,并进行聚类分析。研究结果显示亚麻单株粒重与分茎数、主茎分枝数、单株有效果数存在显著正相关,株高与工艺长显著正相关。聚类分析将499份资源分成了3类,种群1更有利于亚麻高产育种,种群2有利于抗倒伏亚麻新品种的选育。

关键词: 亚麻, 农艺性状, 相关性, 聚类分析, R语言

Abstract:

Through the research on further phenotype identification of flax germplasm resources from Hebei Province germplasm repository, we aim to explore the correlation of the resources’ agronomic traits, and provide a certain base for flax breeding. We took 499 flax germplasm resources as materials, and used R language to conduct the correlation analysis of flax agronomic traits to get their correlation coefficients, and carried out the cluster analysis. Research results showed that: the weight per plant had a significantly positive correlation with the stem number, the branch number of main stem and the effective number, while the plant height had a significantly positive correlation with the stem length. Clustering analysis showed that the 499 germplasm resources were divided into 3 groups, group 1 was suitable for high yield breeding, while group 2 for lodging resistance breeding.

Key words: Flax, Agronomic Traits, Correlation, Cluster Analysis, R Language

中图分类号:

S563.2

张丽丽, 耿立格, 孙娟, 王玉祥, 曲志华, 李世芳, 乔海明. 基于R语言的亚麻种质资源农艺性状相关及聚类分析[J]. 农学学报, 2020, 10(1): 7-12.

Zhang Lili, Geng Lige, Sun Juan, Wang Yuxiang, Qu Zhihua, Li Shifang, Qiao Haiming. Agronomic Traits of Flax Germplasm Resources: Relationship and Cluster Analysis Based on the R Language[J]. Journal of Agriculture, 2020, 10(1): 7-12.

图/表 7

参考文献 25

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原产地	材料份数	原产地	材料份数
意大利	1	加拿大	7
CF RES BR	33	美国	57
阿富汗	2	摩洛哥	2
阿根廷	40	南美	5
埃及	3	日本	1
埃塞俄比亚	5	土耳其	6
澳大利亚	1	危地马拉	1
奥地利	2	乌拉圭	2
巴基斯坦	32	西班牙	4
巴尼它巴	2	希腊	4
中国	72	新西兰	1
北美	64	匈牙利	31
波兰	15	叙利亚	3
不列颠	3	伊朗	5
德国	1	以色列	2
俄罗斯	29	意大利	1
法国	34	印度	20
荷兰	9

原产地	材料份数	原产地	材料份数
意大利	1	加拿大	7
CF RES BR	33	美国	57
阿富汗	2	摩洛哥	2
阿根廷	40	南美	5
埃及	3	日本	1
埃塞俄比亚	5	土耳其	6
澳大利亚	1	危地马拉	1
奥地利	2	乌拉圭	2
巴基斯坦	32	西班牙	4
巴尼它巴	2	希腊	4
中国	72	新西兰	1
北美	64	匈牙利	31
波兰	15	叙利亚	3
不列颠	3	伊朗	5
德国	1	以色列	2
俄罗斯	29	意大利	1
法国	34	印度	20
荷兰	9

农艺性状	分群1	分群2	分群3
株高	54.54449	44.01458	60.16814
工艺长	29.18199	23.6535	36.54733
分茎数	1.26489	0.853399	0.612857
主茎分枝数	4.545404	3.563987	3.875714
单株有效果数	31.07445	16.06967	17.22714
单株无效果数	1.433272	1.084248	0.564762
每果粒数	7.204779	6.872549	7.224762
单株粒重	0.885044	0.502533	0.549729

农艺性状	分群1	分群2	分群3
株高	54.54449	44.01458	60.16814
工艺长	29.18199	23.6535	36.54733
分茎数	1.26489	0.853399	0.612857
主茎分枝数	4.545404	3.563987	3.875714
单株有效果数	31.07445	16.06967	17.22714
单株无效果数	1.433272	1.084248	0.564762
每果粒数	7.204779	6.872549	7.224762
单株粒重	0.885044	0.502533	0.549729

基于R语言的亚麻种质资源农艺性状相关及聚类分析

Agronomic Traits of Flax Germplasm Resources: Relationship and Cluster Analysis Based on the R Language

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